I pulmonologi brukes medisinsk oksygen på følgende måte:
- Til behandling av hypoksi og hypoksemi.
- I mekanisk lungeventilasjon ved behandling av nedsatt respirasjon.
- I behandlingen av sykdommer som kronisk obstruktiv lungesykdom (KOLS), pneumokoniose, lungebetennelse, hjerteinfarkt og lungeemboli.
- Som et ledd i behandling av kullosforgiftning.